やったことメモ

• 20日（月）
  • 研究所が休業（強制）だったので、研究室へ行ってゼミへ出る
• 21日（火）
  • ゼミ合宿のスライド修正
  • gSpan が難しくて理解が追いつかない... orz（それでもだいぶ理解できてきた）
• 22日（水）
  • ゼミ合宿チームミーティング、発表練習
• 23日（木）
  • 研究所に戻ってくる
  • 新しく提供された RHEL6 のサーバに必要なソフトウェアなどをインストール
    • RHEL 6.3 と MySQL 5.5.27 では、mysql.gem のインストールに失敗する
    • いろいろ調べて、いくつかのコンパイルオプションも渡してみたが、うまくいかない
    • 5.5 を使いたかったが、仕方なく 5.1 にダウングレードしてもらった
    • MySQL-devel は Oracle が提供する（本家の）開発用ライブラリというのを知った
  • RHEL で connect-proxy をインストールしようとしたら、デフォルトのレポジトリには存在しなかったので、pkgs.org を利用した
    • http://pkgs.org/centos-6-rhel-6/atrpms-x86_64/connect-proxy-1.93-2.el6.x86_64.rpm.html
• 24日（金）
  • 先週から方針転換で、遺伝子のもつ性質や特徴を表すリソースの階層構造を、多次元分析用に準備し始める
  • リソースのURIをHTTP GETしても、インスタンス毎のRDFが提供されていないという事なので、人間向けのHTMLからスクレイピングしようとする
    • Nokogiri を使おうとしたが、なかなかうまくいかないので Hpricot を使った
  • SemanticJSON というのが用意されているという事で、こちらを利用することに
    • リソースにおける上下概念の取得が割と簡単にできるということで、期待